Родовідні дерева можна визначити обчислювальним шляхом за допомогою різних алгоритмів. Для цього використовується так званий аналіз послідовності, під час якого ДНК аналізується на відповідність ділянок (послідовностей). обстежено стає. Найбільш часто використовувані методи: Максимальна скупість (MP)
Розуміння філогенезу багато в чому схоже на читання сімейного дерева. Корінь дерева представляє родовід, а кінчики гілок представляють нащадків цього предка . Рухаючись від кореня до кінчика, ви рухаєтеся вперед у часі.
Філогенетичне дерево – це a Дерево, що представляє еволюційні зв’язки між різними видами або іншими суб’єктами, які, як вважають, мають спільного предка.
Кругові дерева можна читати так само, як і дерева, показані вище відносна глибина вузлів вказує на ступінь зв'язку між кінцевими точками . Кругове філогенетичне дерево, що зображує взаємозв’язки між основними групами живих організмів (синій = бактерії; зелений = археї; рожевий = еукаріоти).
Чим менше число, тим схожіші послідовності (і чим коротша гілка). Щоб виміряти різницю між двома певними послідовностями в дереві, просто додайте довжини гілок уздовж найкоротшого шляху між кожною послідовністю в дереві.
Для легкої ідентифікації клади можна використовувати філогенетичне дерево. Уявіть, що ви зрізаєте будь-яку гілку з дерева. Усі лінії цієї гілки утворюють клад . Якщо вам потрібно зробити більше одного розрізу, щоб відокремити групу організмів від решти дерева, ця група не утворює кладу.